Dans un département, la Préfecture a de nombreuses missions sous l’autorité du Préfet qui représente l’État dans le département et coordonne l’action des services déconcentrés de l’État. En matière de prévention des risques majeurs, le Préfet coordonne les actions de prévention et d’information préventive des populations et évalue l’état de préparation aux risques. En période d’évènements majeurs, le Préfet prend la direction des secours et active le dispositif ORSEC (organisation de la réponse de sécurité civile).
Une Préfecture départementale s’organise en plusieurs services auxquels sont rattachés des missions spécifiques. Une des missions de la Préfecture est d’assurer l’ordre public et la protection des populations. Ainsi, les services des Préfectures sont des acteurs de la prévention des risques majeurs à travers l’organisation de la sécurité civile. Ces missions sont généralement au sein d’un service dénommé le Service Interministériel de Défense et Protections.